Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SWI5Q1ZZU3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SWI5Q1ZZU3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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