Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ECM1Q16610 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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ECM1Q16610 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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ECM1Q16610 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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ECM1Q16610 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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ECM1Q16610 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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ECM1Q16610 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ECM1Q16610 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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