Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PKN1Q16512 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms