Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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E2F4Q16254 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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E2F4Q16254 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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E2F4Q16254 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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E2F4Q16254 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F4Q16254 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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E2F4Q16254 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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E2F4Q16254 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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E2F4Q16254 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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E2F4Q16254 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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E2F4Q16254 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F4Q16254 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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