Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NEDD8Q15843 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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NEDD8Q15843 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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