Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NKX1-1Q15270 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NKX1-1Q15270 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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