Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SNX17Q15036 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SNX17Q15036 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SNX17Q15036 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX17Q15036 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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SNX17Q15036 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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