Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CAPRIN1Q14444 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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