Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CSHL1Q14406 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CSHL1Q14406 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.4 ms