Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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