Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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