Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTCH1Q13635 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTCH1Q13635 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTCH1Q13635 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTCH1Q13635 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTCH1Q13635 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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