Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ITGB3BPQ13352 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms