Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
DUSP4Q13115 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
DUSP4Q13115 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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