Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KCNMA1Q12791 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms