Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.54
PTPRBP23467 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRBP23467 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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