Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms