Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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RTN1Q16799 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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