Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NEDD8Q15843 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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NEDD8Q15843 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
NEDD8Q15843 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
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