Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC85BQ15834 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC85BQ15834 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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