Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.08□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ALX1Q15699 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ALX1Q15699 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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