Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SURF1Q15526 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SURF1Q15526 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms