Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NKX1-1Q15270 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NKX1-1Q15270 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NKX1-1Q15270 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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