Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXE3Q13461 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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