Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SKP2Q13309 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SKP2Q13309 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms