Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHD3Q12873 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHD3Q12873 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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