Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CKAP4Q07065 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CKAP4Q07065 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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