Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ITGA8P53708 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ITGA8P53708 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGA8P53708 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ITGA8P53708 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGA8P53708 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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