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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6
OPN4, Melanopsin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
OPN4
Q9UHM6
RN7SKP12-201
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143 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-388P-201
ENST00000517012
105 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-389P-201
ENST00000517048
105 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AP003327.1-201
ENST00000529684
127 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR3646-201
ENST00000578301
84 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC092634.7-201
ENST00000621022
103 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU4-84P-201
ENST00000364200
139 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-200P-201
ENST00000364743
107 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.470-201
ENST00000384307
117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.476-201
ENST00000384347
108 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.497-201
ENST00000384447
98 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
SNORD37.2-201
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66 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6ATAC23P-201
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123 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-588P-201
ENST00000410281
105 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.617-201
ENST00000410920
90 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC096949.1-201
ENST00000412047
152 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MTATP6P21-201
ENST00000440681
189 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU7-79P-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP134-201
ENST00000516492
96 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP94-201
ENST00000516917
108 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR4491-201
ENST00000581087
68 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC011603.4-201
ENST00000611325
277 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR6082-201
ENST00000613604
109 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
HOTAIRM1_4.1-201
ENST00000617934
102 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR3658-201
ENST00000636291
56 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.240-201
ENST00000364469
95 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
LINC00345-201
ENST00000443679
285 nt
TSL 5
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORA68.3-201
ENST00000515906
83 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-138P-201
ENST00000515952
107 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-469P-201
ENST00000516253
101 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP33-201
ENST00000516687
98 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-765P-201
ENST00000516916
99 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU7-35P-201
ENST00000517174
62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
AC107958.3-201
ENST00000553410
431 nt
TSL 3
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR3678-201
ENST00000578455
94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR4305-201
ENST00000583252
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
uc_338.16-201
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95 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.120-201
ENST00000363304
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP517-201
ENST00000364724
117 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1318P-201
ENST00000365389
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORA32-201
ENST00000384072
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BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
snosnR66.1-201
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99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR1197-201
ENST00000408818
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BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORD71-201
ENST00000411292
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BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
AL512326.2-201
ENST00000426359
151 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-240P-201
ENST00000516098
97 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORA25.12-201
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OPN4
Q9UHM6
RNU7-121P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-861P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU2-60P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
AC133485.4-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
AC138907.4-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
DNAJC19P2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
AL109933.3-201
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188 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
G3BP1-214
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIRLET7D-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORD115-20-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-716P-201
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.567-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORA40.8-201
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126 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU7-120P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU2-35P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORA25.16-201
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121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR4514-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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211 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.32-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.174-201
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105 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-682P-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.531-201
ENST00000384589
121 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR518A1-201
ENST00000385068
85 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR644A-201
ENST00000385262
94 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.697-201
ENST00000516776
113 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.700-201
ENST00000516806
100 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
DEFB131E-201
ENST00000532329
154 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MTND5P34-201
ENST00000568888
325 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
MIR548AE2-201
ENST00000583456
67 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORA25.18-201
ENST00000607153
114 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
NEAT1_2.1-201
ENST00000620525
105 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.30-201
ENST00000362572
97 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNY1P11-201
ENST00000363759
113 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.441-201
ENST00000384123
112 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORA8.2-201
ENST00000384372
139 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.536-201
ENST00000384621
113 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-291P-201
ENST00000384720
107 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-535P-201
ENST00000384722
107 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU7-164P-201
ENST00000459221
62 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.690-201
ENST00000516603
95 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORA31.14-201
ENST00000516728
116 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
SNORA81.3-201
ENST00000517283
198 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
C9orf84-203
ENST00000374287
4721 nt
APPRIS P3
TSL 5
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU4-58P-201
ENST00000363192
141 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP133-201
ENST00000363368
119 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
OPN4
Q9UHM6
RNU6-309P-201
ENST00000364573
106 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
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