Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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