Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RRN3Q9NYV6 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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RRN3Q9NYV6 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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RRN3Q9NYV6 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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