Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RBM28Q9NW13 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms