Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SWI5Q1ZZU3 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SWI5Q1ZZU3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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