Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HIF1AQ16665 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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