Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNCBQ16143 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNCBQ16143 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNCBQ16143 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNCBQ16143 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNCBQ16143 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNCBQ16143 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNCBQ16143 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNCBQ16143 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
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