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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
PMCHL1-202
ENST00000423102
261 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
SNORD2-201
ENST00000459163
69 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.695-201
ENST00000516715
107 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
RNU6-1213P-201
ENST00000517075
94 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
IGHVIII-67-2-201
ENST00000519849
88 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
C8orf59P2-201
ENST00000603441
271 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Evf-2_5p.1-201
ENST00000614213
142 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
U2.1-201
ENST00000618978
145 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
AC087741.2-201
ENST00000619415
172 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
MTND5P26-201
ENST00000426018
1752 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.6-201
ENST00000362350
114 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
snoU2_19.2-201
ENST00000363024
80 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.150-201
ENST00000363562
102 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.353-201
ENST00000365440
108 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.556-201
ENST00000384677
113 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.601-201
ENST00000410500
113 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
MTND3P3-201
ENST00000505004
126 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
RNU6-911P-201
ENST00000516523
104 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
RNU6-850P-201
ENST00000516934
103 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.715-201
ENST00000517082
110 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
AC144568.1-201
ENST00000520139
137 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
AP001362.1-201
ENST00000625165
124 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
SNCB
Q16143
Y_RNA.342-201
ENST00000365352
113 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-54P-201
ENST00000365563
107 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.432-201
ENST00000384087
111 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.458-201
ENST00000384240
102 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR29B1-201
ENST00000385015
81 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-1248P-201
ENST00000391096
64 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR548F5-201
ENST00000408421
86 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC008440.2-201
ENST00000413496
423 nt
TSL 5
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MTND1P1-201
ENST00000445453
368 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-956P-201
ENST00000458868
103 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
DLEU2_1.1-201
ENST00000612089
120 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR376B-201
ENST00000614515
100 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
DLEU2_1.2-201
ENST00000614667
120 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-1272P-201
ENST00000362776
107 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.98-201
ENST00000363109
102 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.136-201
ENST00000363444
102 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-1125P-201
ENST00000363601
107 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.359-201
ENST00000365498
102 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.389-201
ENST00000383924
113 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-472P-201
ENST00000384299
107 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.531-201
ENST00000384589
121 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MT-TT-201
ENST00000387460
66 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.596-201
ENST00000410462
109 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.622-201
ENST00000411091
108 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
SNORD42B-201
ENST00000458893
67 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC082651.2-201
ENST00000496833
166 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU2-35P-201
ENST00000516446
142 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-307P-201
ENST00000516743
106 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR5688-201
ENST00000580619
83 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.328-201
ENST00000365208
113 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNY1P6-201
ENST00000384193
109 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.515-201
ENST00000384535
112 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC096644.2-201
ENST00000429278
159 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-1149P-201
ENST00000516810
97 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-762P-201
ENST00000517107
102 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR6818-201
ENST00000621576
65 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR1321-201
ENST00000637766
79 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.24-201
ENST00000362508
103 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.88-201
ENST00000363029
99 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.293-201
ENST00000364908
93 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.482-201
ENST00000384377
111 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
DEFB108C-201
ENST00000400154
252 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU2-51P-201
ENST00000410708
197 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC073641.1-201
ENST00000425192
429 nt
TSL 3
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC079760.1-201
ENST00000456952
202 nt
TSL 3
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-507P-201
ENST00000516045
100 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU7-4P-201
ENST00000516961
62 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
CR383656.11-201
ENST00000552261
498 nt
TSL 3
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC009779.6-201
ENST00000603972
165 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU2-4P-201
ENST00000606190
192 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.86-201
ENST00000363020
111 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.244-201
ENST00000364484
109 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNY3-201
ENST00000365484
102 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR889-201
ENST00000401280
79 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-373P-201
ENST00000411247
98 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU7-70P-201
ENST00000516941
66 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
AC107958.3-201
ENST00000553410
431 nt
TSL 3
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
ST7-AS2_1.1-201
ENST00000622900
72 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.152-201
ENST00000363578
100 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.303-201
ENST00000364998
94 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-746P-201
ENST00000384112
109 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
RNU6-21P-201
ENST00000384710
107 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
TRAJ2-201
ENST00000390535
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
PLS1-AS1-201
ENST00000485338
346 nt
TSL 3
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
MIR6888-201
ENST00000621977
67 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
snoR1.1-201
ENST00000628177
80 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SNCB
Q16143
Y_RNA.143-201
ENST00000363520
106 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-1130P-201
ENST00000365434
107 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-102P-201
ENST00000384485
104 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-30P-201
ENST00000384561
107 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-1246P-201
ENST00000391064
107 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.605-201
ENST00000410577
105 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-561P-201
ENST00000516222
102 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
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