Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIXQ14938 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms