Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NEDD9Q14511 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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NEDD9Q14511 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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NEDD9Q14511 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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NEDD9Q14511 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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NEDD9Q14511 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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NEDD9Q14511 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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NEDD9Q14511 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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