Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARF1Q14162 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCARF1Q14162 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SCARF1Q14162 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCARF1Q14162 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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