Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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