Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ATMQ13315 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATMQ13315 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATMQ13315 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ATMQ13315 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATMQ13315 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
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