Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEMA3FQ13275 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEMA3FQ13275 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms