Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN3Q13064 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.4 ms