Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CNTN1Q12860 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CNTN1Q12860 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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CNTN1Q12860 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CNTN1Q12860 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CNTN1Q12860 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CNTN1Q12860 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CNTN1Q12860 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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