Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRDP23468 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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PTPRDP23468 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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PTPRDP23468 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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PTPRDP23468 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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PTPRDP23468 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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PTPRDP23468 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRDP23468 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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