Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BRPF3Q9ULD4 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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