Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEURL3Q96EH8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEURL3Q96EH8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.9 ms