Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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