Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
DDX54Q8TDD1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms