Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CHSY3Q70JA7 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CHSY3Q70JA7 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CHSY3Q70JA7 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CHSY3Q70JA7 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHSY3Q70JA7 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CHSY3Q70JA7 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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CHSY3Q70JA7 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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