Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TMEM200BQ69YZ2 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms